Beyblade: Metal Fusion is gebaseerd op de gelijknamige animatieserie. De game vertelt een nieuw verhaal in de wereld van de bekende personages van Beyblade. De sterkste Beybladers zijn opgesloten in een kasteel en moeten met hun tollen vechten tegen verschillende “Robot Bladers” om erachter te komen wat er aan de hand is. Wie heeft de jonge strijders gevangen genomen en waarom?

Beyblade: Metal Fusion kan ook met meerdere spelers gespeeld worden in de “Battle Mode”. In deze modus kunnen vier spelers het tegen elkaar opnemen of kan er worden samengewerkt om tegen de computer te vechten. De arena’s waarin de gevechten plaatsvinden zijn door de spelers zelf aan te kleden.